Un test rapide du liquide céphalo-rachidien réduit le délai de diagnostic des tumeurs cérébrales

Un test qui recherche les caractéristiques génétiques des cancers du cerveau dans des échantillons de liquide céphalo-rachidien peut réduire le temps nécessaire au diagnostic et éliminer le besoin de biopsies cérébrales invasives pour certains patients. Les experts de Mass General Brigham en neurochirurgie, cancer et pathologie ont travaillé ensemble pour développer un test de génotypage rapide capable de détecter les mutations clés associées aux cancers du cerveau à partir d'échantillons prélevés lors d'une ponction lombaire.

L'équipe a évalué la technique connue sous le nom de TetRS (Targeted Rapid Sequencing) parmi 70 patients admis au Massachusetts General Hospital avec de nouvelles lésions du système nerveux central (SNC) d'origine inconnue.

Le test a détecté des mutations dans des échantillons provenant de 42 % des patients atteints de tumeurs, notamment des cas de lymphomes primaires et secondaires du SNC, de glioblastome et de gliomes. Les résultats sont publiés dans un article intitulé « Rapid Tumor DNA Analysis of Cerebrospinal Fluid Accelerates Treatment of Central Nervous System Lymphoma » dans la revueSang.

“Contrairement à d'autres formes de cancer qui pourraient être diagnostiquées dans un centre ambulatoire, la plupart des tumeurs cérébrales et des tumeurs de la moelle épinière sont diagnostiquées à l'hôpital, où les patients présentent souvent des déficits rapidement progressifs. Cela signifie que la rapidité est essentielle”, a déclaré l'auteur correspondant. Ganesh Shankar, MD, Ph.D., neurochirurgien et directeur neurochirurgical de la banque d'échantillons biologiques pour le département de neurochirurgie du Massachusetts General Hospital (MGH).

“Grâce au test que nous avons développé, les patients sont désormais diagnostiqués et traités sans biopsie cérébrale, ce qui a également permis de réduire le délai d'obtention du diagnostic de 10 jours à deux jours.”

Shankar retrace les origines du TetRS il y a près d’une décennie, à une époque où les chercheurs ont identifié une poignée de gènes mutés dans certaines formes de cancer du cerveau. Dans un article publié en 2015, l’équipe a montré que des mutations génétiques pouvaient être détectées dans des échantillons de tissus prélevés lors d’une intervention chirurgicale. L’équipe a encore optimisé TetRS et a montré en 2021 qu’elle pouvait utiliser la même approche sur le liquide céphalo-rachidien.

La nouvelle étude met TetRS à l’épreuve dans le monde réel, où les patients peuvent se présenter au service des urgences avec une lésion anormale qui pourrait provenir d’une tumeur ou d’autre chose. L’équipe de recherche voulait s’assurer que TetRS pourrait aider à établir un diagnostic précis plus rapidement, sans laisser de place à un résultat faussement positif.

Shankar et ses collègues ont conçu TetRS pour rechercher des signatures génétiques uniques au cancer du cerveau, notamment des mutations dans les gènes MYD88, promoteur TERT, IDH1, IDH2, BRAF et H3F3A. L'équipe a évalué des échantillons provenant de 70 patients, dont 33 ont finalement reçu un diagnostic de néoplasmes (tissus anormaux pouvant être bénins ou malins).

TetRS à lui seul a diagnostiqué six des patients et, lorsqu'il est combiné avec des méthodes conventionnelles, a diagnostiqué huit patients supplémentaires, pour une sensibilité totale de 42 %. Pour les 37 autres patients n’ayant pas reçu de diagnostic de néoplasme, TetRS n’a renvoyé aucun faux positif, pour un taux de spécificité de 100 %.

L’utilisation du test de génotypage rapide a éliminé le besoin de biopsies cérébrales chirurgicales pour sept patients et a considérablement accéléré le délai de traitement pour eux, d’une moyenne de 12 jours à une moyenne de trois jours.

Les auteurs notent que des études plus vastes sont nécessaires pour déterminer si leurs résultats sont largement applicables et quel sera l'impact clinique d'un diagnostic et d'un traitement plus précoces pour les patients.

TetRS a été mis en œuvre en tant que test cliniquement disponible dans Mass General Brigham, et Mass General Brigham Pathology a reçu et évalué des échantillons de patients du MGH, du Brigham and Women's Hospital et de nombreux autres sites à travers le pays.

“En travaillant ensemble avec des équipes de pathologie, de neuro-oncologie et de neurochirurgie, nous avons développé une manière innovante et collaborative d'améliorer les soins aux patients”, a déclaré la co-auteure Deborah Forst, MD, du Mass General Cancer Center.

“La capacité de détecter rapidement des variantes moléculaires liées à la tumeur dans les échantillons de liquide céphalo-rachidien des patients nous a permis de tirer rapidement des conclusions diagnostiques grâce à des tests moins invasifs et de lancer rapidement des chimiothérapies individualisées et potentiellement salvatrices.”