Méthode basée sur la transcriptomique spatiale pour cartographier les récepteurs des lymphocytes B et des lymphocytes T. La capture ciblée de séquences de récepteurs d'antigènes à partir de bibliothèques d'expression génique de transcriptomique spatiale résout la distribution complète des récepteurs aux côtés de l'anatomie tissulaire et du transcriptome entier dans des coupes de tissus humains. Spatial VDJ découvre la dynamique clonale des cellules B et T, notamment en reliant les clones à l’expression génique associée à la tumeur, en appariant les chaînes de récepteurs et en reconstruisant les trajectoires spatiales de la lignée des cellules B. Crédit: Science (2023). DOI : 10.1126/science.adf8486
Une nouvelle méthode, développée au Karolinska Institutet, au KTH Royal Institute of Technology et à SciLifeLab en Suède, permet d'identifier des récepteurs de cellules immunitaires uniques et leur emplacement dans les tissus, selon une étude publiée dans la revue Science rapports. Les chercheurs prédisent que la méthode améliorera la capacité d’identifier les cellules immunitaires qui contribuent aux processus pathologiques et ouvrira la voie au développement de nouveaux traitements pour de nombreuses maladies.
Les cellules immunitaires telles que les lymphocytes T et B jouent un rôle central dans la défense de l'organisme contre les infections et les tumeurs. Les deux types de cellules immunitaires expriment des récepteurs uniques qui reconnaissent spécifiquement différentes parties d’éléments indésirables et étrangers, tels que les bactéries, les virus et les tumeurs. Chaque cellule immunitaire et sa descendance possèdent ses propres récepteurs spécifiques, et dans chaque corps humain, il existe des milliards de cellules immunitaires différentes dotées de récepteurs uniques.
Des chercheurs du Karolinska Institutet, du KTH Royal Institute of Technology et de SciLifeLab ont développé une méthode capable à la fois d'identifier les différents récepteurs des lymphocytes B et T et de révéler leur emplacement dans les tissus humains.
De nombreux domaines d'application
“Étant donné que les cellules immunitaires activées se trouvent souvent à proximité des cibles qu'elles attaquent, nous voulons pouvoir cartographier les cellules qui sont effectivement les plus proches d'une tumeur ou d'une infection”, explique Camilla Engblom, professeur adjoint au Département de médecine (Solna). , Karolinska Institutet et l'un des trois auteurs principaux de l'étude avec Kim Thrane, KTH/SciLifeLab, et Qirong Lin, Karolinska Institutet.
“Il n'a pas été possible d'identifier les récepteurs des lymphocytes B et T dans leurs microenvironnements en utilisant les méthodes précédentes.”
Selon le Dr Engblom, il existe un large éventail de domaines dans lesquels la nouvelle technique pourra être utilisée en clinique à l'avenir.
“Dans le cas du cancer, la méthode permet d'identifier les lymphocytes T susceptibles d'attaquer la tumeur”, explique-t-elle.
“Ils pourraient ensuite être utilisés comme thérapie cellulaire contre le cancer. Nous pouvons également identifier des récepteurs uniques sur les cellules B qui sont libérés sous forme d'anticorps dans des zones spécifiques de la tumeur. Ces anticorps peuvent être produits en laboratoire avec une relative facilité et éventuellement donner naissance à “
Une avancée importante
Jeff Mold, l'un des principaux chercheurs de l'étude et chercheur au Département de biologie cellulaire et moléculaire du Karolinska Institutet, considère la nouvelle méthode comme un pas en avant important.
“Identifier ces récepteurs immunitaires uniques, c'est comme essayer de trouver une aiguille dans une botte de foin, surtout lorsqu'il s'agit de maladies auto-immunes”, dit-il. “Avec la plupart des méthodes actuelles, vous détruisez les tissus, ce qui signifie non seulement que différentes cellules immunitaires sont mélangées, mais également que certaines cellules meurent au cours du processus. Avec cette méthode, nous préservons les cellules là où elles se trouvent et nous pouvons voir les cellules. cela aurait autrement été perdu.
Le Dr Mold estime que la capacité d’identifier les cellules B est sans doute le principal avantage de cette nouvelle méthode.
“Les lymphocytes T ont été une cible de recherche populaire, tandis que les lymphocytes B ont été un peu négligés, notamment dans le cancer”, dit-il. “Mais nous pouvons désormais suivre le développement et l'expansion des cellules B directement dans les tissus.”
Plus d'information:
Camilla Engblom et al, La transcriptomique spatiale des récepteurs des cellules B et T révèle la dynamique clonale des lymphocytes, Science (2023). DOI : 10.1126/science.adf8486. www.science.org/doi/10.1126/science.adf8486
Fourni par l'Institut Karolinska
Citation: Une nouvelle méthode est mieux à même de cartographier la réponse immunitaire et ouvre la voie à de nouveaux traitements (7 décembre 2023) récupéré le 7 décembre 2023 sur
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