Des chercheurs cartographient le pangénome du raisin sauvage d’Amérique du Nord

Les raisins sauvages d'Amérique du Nord sont désormais moins mystérieux après qu'une équipe internationale de chercheurs dirigée par l'Université de Californie à Davis a décodé et catalogué la diversité génétique de neuf espèces de cette précieuse culture viticole.

La recherche, publiée dans la revue Biologie du génomerévèle des caractéristiques critiques qui pourraient accélérer les efforts de sélection des raisins, en particulier pour relever des défis tels que le changement climatique, les environnements salins et la sécheresse.

“Cette recherche marque une étape importante dans la compréhension de la génétique de la vigne”, a déclaré Dario Cantù, auteur principal de l'article de la revue et professeur au Département de viticulture et d'œnologie. “Il jette les bases des progrès futurs dans la sélection du raisin en identifiant les gènes clés responsables de caractères importants.”

L'équipe de recherche a développé et utilisé une technologie de pointe pour construire un pangénome complet, qui est un modèle génétique complet d'espèces de raisins sauvages.

Ce soi-disant super-pangénome de neuf espèces a permis à l'équipe de cartographier la diversité génétique, d'identifier les similitudes ou les différences entre elles et d'identifier les traits spécifiques que les sélectionneurs pourraient vouloir intégrer. Le premier auteur Noé Cochetel, chercheur postdoctoral dans le laboratoire de Cantù, a effectué les analyses et a joué un rôle central dans le projet.

Il s'agit du premier pangénome du raisin sauvage d'Amérique du Nord à être cartographié et catalogué, a déclaré Cantù.

“Cela offre un énorme potentiel pour faire progresser la culture durable du raisin, en particulier dans les régions confrontées à des problèmes de pénurie d'eau”, a déclaré Cantù, biologiste végétal qui est également titulaire de la chaire Louis P. Martini Endowed. “Ce pangénome permettra une exploration génétique plus approfondie d'autres traits adaptatifs vitaux essentiels à la résilience de l'industrie, comme la tolérance à la sécheresse, la résistance à la chaleur et la défense contre la maladie de Pierce.”

Causée par une souche de la bactérie Xylella fastidiosa, la maladie de Pierce tue les vignes en obstruant leurs vaisseaux conducteurs d'eau.

Avantages et inconvénients du raisin sauvage

Les raisins nord-américains sont connus pour leur résistance aux maladies et leur adaptabilité, mais ils ne sont pas privilégiés pour le goût et la qualité du vin. Les vignes européennes comme le chardonnay et le cabernet sauvignon sont moins résistantes aux maladies mais sont réputées pour produire des vins de grande qualité.

Les espèces nord-américaines ont une vaste aire de répartition géographique. En conséquence, ils ont évolué pour résister à diverses conditions climatiques, pédologiques et pathogènes, englobant un large spectre de diversité génétique.

C'est pourquoi presque tous les raisins de cuve produits dans le monde proviennent de vignes européennes greffées sur des porte-greffes nord-américains.

Possibilité de sélectionner des traits

Le pangénome détaillé permettra aux sélectionneurs d'incorporer de manière sélective les caractéristiques souhaitées des raisins sauvages, telles que la tolérance au sel, tout en évitant les caractéristiques moins souhaitables.

“La tolérance au sel est une caractéristique cruciale pour les porte-greffes”, a noté Cantù. “L'identification de ces caractères au niveau génétique constitue une avancée majeure pour la sélection du raisin.”