Estimation du moment d’émergence du MPXV dans la population humaine à partir de l’accumulation de mutations de type APOBEC3. (A) Génomes MPXV échantillonnés à partir d’infections humaines de 2017 à 2022, avec une séquence externe d’une épidémie au Nigeria en 1971. Les mutations le long de chaque branche sont indiquées par des cercles colorés selon qu’il s’agit ou non d’une édition putative d’APOBEC3 (TC → TT et GA → AA ; rouge) ou s’il s’agit d’un autre type de mutation (jaune). (B) Mutations APOBEC3 des génomes MPXV échantillonnés depuis 2017. L’ancêtre commun le plus récent (MRCA) reconstruit du panel Une phylogénie est utilisée comme racine dans le tracé de la racine à la pointe, et l’interception y est utilisée comme proxy pour moment de l’émergence, qui est déduit en ajustant une régression bayésienne aux dates de séquence du panneau A. (C) Phylogénie de crédibilité maximale du clade (MCC) du clade IIb du MPXV avec le temps absolu indiqué sur l’axe des x. (D) Estimation de la taille effective de la population de l’épidémie à l’aide d’un modèle Skygrid coalescent non paramétrique avec 11 points de changement sur une période de 8,5 ans. Crédit: Science (2023). DOI : 10.1126/science.adg8116
Une grande équipe internationale de chercheurs médicaux et d’épidémiologistes a découvert des preuves que la variole du singe (mpox) circule chez l’homme depuis 2016. Dans leur étude, rapportée dans la revue Sciencele groupe a utilisé l’analyse évolutive bayésienne du virus mpox pour montrer que son histoire génomique comprend des années de changements dus à des infections humaines.
La Mpox a été identifiée pour la première fois dans les années 1950 après qu’une maladie ait frappé un groupe de singes expérimentaux au Danemark. Vingt ans plus tard, le premier cas était détecté chez un humain en Afrique. Au cours des décennies suivantes, plusieurs cas de la maladie ont été observés chez l’homme et tous ont été attribués au virus provenant d’autres mammifères.
Puis, en 2017, une épidémie s’est déclarée au Nigeria et, en 2022, elle s’est propagée à travers le monde, démontrant que le virus avait évolué pour passer d’humain à humain. Dans ce nouvel effort, l’équipe de recherche a examiné de plus près le génome du virus derrière le mpox pour en savoir plus sur son histoire évolutive, en particulier sur ses liens avec les infections humaines.
Les chercheurs ont séquencé le génome du virus mpox pour en savoir plus sur son histoire évolutive. Ils ont découvert que le clade IIb était celui qui s’était répandu dans le monde entier. Ils ont également noté qu’elle était différente des autres souches déjà observées en Afrique.
Ils ont découvert une mutation qui avait conduit à la production d’une enzyme appelée APOBEC3, qui provoquait d’autres mutations altérant les paires de bases du génome. Il a également été constaté que cela était dû à des infections chez l’homme. Cela a permis à l’équipe de retracer l’histoire évolutive du virus au fur et à mesure qu’il infectait les humains : ils ont trouvé de telles mutations remontant à environ 2016, ce qui suggère fortement que le virus est transmissible entre humains depuis cette année-là.
L’équipe de recherche conclut qu’il existe une forte probabilité de cas multiples de petites épidémies de mpox qui n’ont pas été reconnues, permettant au virus de se propager sous le radar. Ils suggèrent en outre que des méthodes de surveillance plus strictes soient mises en place, car le virus continue de muter rapidement et pourrait devenir plus mortel.
Plus d’information:
Áine O’Toole et al, édition de la désaminase APOBEC3 dans le virus mpox comme preuve d’une transmission humaine soutenue depuis au moins 2016, Science (2023). DOI : 10.1126/science.adg8116
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Citation: Des chercheurs trouvent des preuves que le mpox circule chez l’homme depuis 2016 (3 novembre 2023) récupéré le 3 novembre 2023 sur
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