Étudier les zones humides pour détecter la grippe aviaire infectieuse et la trouver

Récemment, les omelettes du matin et les dîners de vacances sont devenus plus chers. Une cause probable est la grippe aviaire, dont les épidémies ont entraîné la mort de millions de poulets et de dindes par infection ou par abattage en 2022, selon le ministère américain de l’Agriculture, et qui nécessite toujours une surveillance rigoureuse des populations sauvages.

Maintenant, je fais rapport dans Lettres sur les sciences et technologies de l’environnementdes chercheurs ont développé une méthode permettant de détecter le virus infectieux de la grippe aviaire dans les zones humides fréquentées par la sauvagine.

Les oiseaux sauvages représentent un réservoir important du virus de la grippe aviaire. Bien que certaines souches virales ne provoquent pas de maladie, la forme hautement pathogène de la grippe aviaire (IAHP) peut se propager rapidement et est souvent mortelle. Il se propage par les oiseaux sauvages qui excrétent l’agent pathogène par leurs excréments dans l’environnement, y compris les zones humides qu’ils habitent.

La détection de la grippe aviaire dans ces eaux s’est révélée difficile car les concentrations de virus infectieux sont souvent trop faibles pour être détectées par la plupart des méthodes, ce qui laisse une lacune importante dans notre compréhension de la transmission virale. Pour résoudre ce problème, Laura Hubbard de l’US Geological Survey et ses collègues ont conçu un processus en plusieurs étapes pour concentrer et identifier le virus infectieux dans des échantillons environnementaux.

Ils ont testé leurs protocoles sur des échantillons d’eau de surface prélevés à deux reprises au printemps 2022 dans quatre zones humides et un lac de l’Iowa. L’équipe a identifié des souches de virus infectieux dans des échantillons provenant des quatre sites de zones humides en avril, mais pas dans le lac.

Les taux de détection étaient cependant significativement inférieurs lorsqu’ils testaient les échantillons d’eau pour l’ARN viral (11,1 %) à l’aide de protocoles de diagnostic standard que lorsque les mêmes échantillons étaient inoculés dans des œufs et que le virus de la grippe aviaire était isolé et confirmé (66,7 %). Les chercheurs affirment que ces résultats mettent en évidence la nécessité d’améliorer les techniques de détection de l’ARN pour réduire le risque de faux négatifs.

Le séquençage a montré que la plupart des souches virales détectées présentes dans les échantillons d’eau avaient un faible pouvoir pathogène. Cependant, un échantillon contenait de l’IAHP, ce qui constitue la première fois que cette souche est détectée dans une voie navigable américaine, selon les chercheurs.

Cependant, à peine cinq semaines plus tard, ils n’ont détecté le virus de la grippe aviaire dans aucun échantillon provenant des mêmes sites, malgré des recherches antérieures démontrant la persistance du virus pendant des mois dans des environnements similaires. Les chercheurs suggèrent que l’absence apparente du virus pourrait être due à de nombreux facteurs environnementaux, notamment une présence moindre de sauvagine en mai et des températures de l’eau considérablement plus chaudes qui influencent la survie du virus.

Bien que des recherches plus approfondies soient nécessaires pour mieux comprendre la persistance et la transmissibilité potentielle de la grippe aviaire dans les zones humides, les chercheurs affirment que la détection du virus de l’IAHP et d’autres souches met en évidence les risques possibles pour les oiseaux sauvages et domestiques, d’autres animaux et même les humains, qui utilisent ces cours d’eau à des fins récréatives. . Ils suggèrent également qu’une surveillance régulière et une détection précoce pourraient contribuer à atténuer la transmission virale coûteuse et le coût croissant des œufs et de la volaille.