La distance sociale était plus efficace pour empêcher la transmission locale du COVID-19 que la fermeture des frontières internationales : étude

L'élucidation des réseaux de contacts humains pourrait aider à prédire et à prévenir la transmission du SRAS-CoV-2 et les futures menaces de pandémie. Une nouvelle étude menée par les scientifiques et collaborateurs de Scripps Research indique quels protocoles de santé publique ont fonctionné pour atténuer la propagation du COVID-19 et lesquels n'ont pas fonctionné.

Dans l'étude, publiée en ligne dans Cellule le 14 décembre 2023, l'équipe de scientifiques dirigée par Scripps Research a étudié l'efficacité de différents mandats, notamment les mesures de maintien à domicile, la distanciation sociale et les restrictions de voyage, pour prévenir la transmission locale et régionale pendant différentes phases de la pandémie de COVID-19. .

Ils ont constaté que la transmission locale était déterminée par le nombre de déplacements entre les sites, et non par leur proximité géographique. L’étude a également révélé que la fermeture partielle de la frontière entre les États-Unis et le Mexique n’a pas permis de prévenir la transmission transfrontalière du virus. Ces découvertes, en combinaison avec la surveillance génomique continue, pourraient aider à orienter la politique de santé publique pour prévenir de futures pandémies et atténuer la nouvelle phase « endémique » du COVID-19.

“Nous montrons que ce n'est pas nécessairement la proximité géographique des sites qui compte; la véritable mesure est la façon dont deux sites sont connectés en termes de mouvement des personnes”, explique Mark Zeller, Ph.D., co-auteur principal du projet. et épidémiologiste génomique au laboratoire de Kristian Andersen à Scripps Research. « Le SRAS-CoV-2 est probablement un bon modèle pour la propagation des virus respiratoires en général, et savoir comment ces virus se propagent peut nous aider à développer des mesures ciblées pour de futures pandémies. »

L'étude a été dirigée par des scientifiques de Scripps Research en collaboration avec le comté de San Diego, l'UCSD et divers laboratoires universitaires, laboratoires de santé publique et hôpitaux de Californie et de Basse-Californie, au Mexique.

“Ces informations inestimables aident à orienter les stratégies visant à atténuer la propagation des futures menaces virales, y compris nos méthodes de surveillance génomique en cours, telles que l'analyse des eaux usées”, déclare Seema Shah, MD, directeur médical de la branche des services d'épidémiologie et de vaccination du comté de San Diego.

« À une époque où les défis mondiaux nécessitent des réponses unies, cette étude témoigne également de la collaboration étroite entre les établissements de recherche universitaires, les laboratoires de santé publique et les hôpitaux des deux côtés de la frontière.

Pour expliquer comment les modes de déplacement changeants ont impacté la transmission du COVID-19 au cours des deux premières années de la pandémie, l’équipe a quantifié la similarité génétique entre les séquences virales collectées à différents endroits et à différents moments.

“Plus les génomes du virus sont similaires entre deux endroits différents, plus ces endroits sont connectés en termes de mouvement des personnes”, explique Zeller.

Les chercheurs ont séquencé plus de 82 000 échantillons de SRAS-CoV-2 provenant de San Diego, en Californie et de Basse-Californie, au Mexique et ont comparé ces séquences aux génomes du SRAS-CoV-2 d’Amérique du Nord et du reste du monde. Ensuite, ils ont intégré les données génomiques à une base de données de données sur les voyages aériens et terrestres (basées sur le suivi anonyme des téléphones portables) pour estimer la connectivité des différents comtés d’Amérique du Nord.

Au cours des premières phases de la pandémie, lorsque les mandats liés au COVID-19 comprenaient des mesures strictes de maintien à domicile et de distanciation sociale, la transmission s’est principalement produite au niveau local et régional, à l’intérieur et entre les comtés voisins. Mais à mesure que ces mandats ont été assouplis et que les gens ont commencé à voyager plus librement, comme on pouvait s’y attendre, la transmission depuis des endroits éloignés a augmenté.

“La mobilité entre les comtés voisins est restée presque constante tout au long des deux premières années de la pandémie, mais ce sont ces mouvements sur de longues distances, de San Diego vers des comtés plus éloignés ou vers des États voisins, qui ont été vraiment perturbés par les premiers mandats”, explique l'épidémiologiste génomique et premier auteur Nathaniel Matteson, Ph.D., qui a travaillé sur l'étude en tant qu'étudiant diplômé au laboratoire Andersen de Scripps Research.

“Après l'assouplissement des mandats, environ 50 % du virus circulant à San Diego était le résultat d'un virus circulant localement, et 50 % avait été récemment introduit à la suite de voyages entre les sites.”

L’analyse a également révélé qu’il y avait une transmission continue entre San Diego et la Basse-Californie voisine pendant toute la durée de la pandémie, ce qui suggère que la fermeture partielle de la frontière américano-mexicaine a été inefficace pour prévenir la transmission.

“Cette découverte s'ajoute à un nombre croissant de preuves selon lesquelles ces mesures ciblées qui tentent d'arrêter le flux de personnes à partir d'un endroit spécifique sont tout à fait inefficaces, alors que les mesures de distanciation sociale se sont révélées beaucoup plus efficaces pour réduire la transmission”, explique Matteson. “Cela souligne également l'importance des collaborations régionales et internationales et du partage des ressources pour une surveillance et une prévention efficaces des maladies.”

Les chercheurs prévoient ensuite d’étudier la dynamique de la transmission à une échelle encore plus fine. “Nous étudions maintenant la transmission hyperlocale au sein du comté de San Diego, par exemple la manière dont la transmission est influencée par des éléments tels que les modes de déplacement”, explique Zeller.